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Quali sono i programmi di Statistica più utilizzati in Bioinformatica?

Pubblicato da dalloliogm su giugno 4, 2007

Un lettore di questo blog mi ha lasciato un commento alcuni giorni fa per chiedermi di rispondere ad un suo post:

in cui si chiedeva quali fossero i linguaggi di programmazione o i software di statistica più utilizzati in Bioinformatica.
Il lettore in questione tra l’altro é Daniele Medri, uno statistico molto conosciuto anche per il suo blog e per il manuale Linux Facile, che potreste aver già visto e utilizzato in passato.

 

Giro a voi la domanda: che linguaggi di programmazione usate per motivi statistici?

 

 

 

Io non ho molto spesso a che fare con grossi calcoli, pero’ mi accontento di R e da un po’ di giorni sto pensando di studiare l’estensione numpy di python.
Nella specialistica di bioinformatica qui a Bologna ci hanno insegnato un po’ di Matlab/Gnu Octave, che non é esattamente orientato al lavoro statistico, ma che sempre permette di fare qualcosa.

 

Vi invito a rispondere alla domanda nel post originale, nel caso non l’aveste ancora fatto!! :)

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Una Risposta a “Quali sono i programmi di Statistica più utilizzati in Bioinformatica?”

  1. Giulio ha detto

    Io molto spesso utilizzo MatLab come software per simulazioni (credo sia il migliore), anche se per la statistica applicata ci insegnano il linguaggio R nella specialistica di bioinformatica a Roma

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